OpenWorm

»OpenWorm« zielt darauf ab, das erste umfassende computerbasierte Modell des »Caenorhabditis elegans (C. elegans)« zu konstruieren. Mit nur eintausend Zellen ist dieser mikroskopisch kleine Fadenwurm fähig, solche grundlegenden Probleme wie Nahrungsaufnahme oder Partnersuche zu lösen und Strategien zu entwickeln, Feinden aus dem Weg zu gehen. Obwohl er wissenschaftlich bereits eingehend studiert wurde, entzieht sich dieser Organismus noch immer einem tieferen, prinzipiellen Verständnis seiner biologischen Beschaffenheit.

Wir benutzen einen Bottom-up-Ansatz, um den Wurm zu studieren. Basierend auf den wissenschaftlichen Experimenten, die im Laufe der vergangenen zehn Jahre durchgeführt worden sind, zielen wir darauf ab, die Verhaltensweisen des Wurms aus Datensimulationen abzuleiten. Dazu speisen wir die Gesamtheit der von der wissenschaftlichen Community zur Verfügung gestellten Daten in Softwaremodelle ein. Wir entwickeln die Open-Source-Simulationsplattformen »Geppetto« und »Sibernetic« so weiter, dass sie fähig sind, die verschiedenen Modelle gleichzeitig zu simulieren. Darüber hinaus rufen wir neue Kooperationen mit Universitäten und Forschungsinstituten ins Leben, um die Sammlung weiterer Daten voranzutreiben und noch bestehende Lücken zu füllen.

Die Dokumentation des Werkes ist online verfügbar.